Wii经典手柄中央与Wii遥控手柄一样同样具有-，+和home三个导航键，用于直接访问Wii漂亮的用户界面。可以在任何时候，即使在玩游戏的时候按下Home键跳到Wii频道系统，此时虚拟主机将为正在进行的FC/SFC/N64游戏自动存档。-和+键可使向前和向后在各个菜单中浏览。他们也能在FC/SFC/N64游戏中作为选择和暂停键使用。任天堂还给Wii经典手柄配备了一个双重的摇杆用以N64游戏里的类比操作，以近似于PS3双重震动摇杆的布局。相比SNES的手柄Wii经典手柄顶部多出了两个按钮，说明书还未提及它的作用，任天堂必定还隐藏着Wii的更多细节。除了支持FC/SFC/N64老游戏的操作外，Wii经典手柄还可以用来操作晓之女神，极品飞车等Wii平台的个别游戏。