蚯蚓粪每克含微生物有益菌群约一亿，更可贵的是含有至少两种拮抗微生物。这些大量有益微生物施入土壤后，迅速抑制害菌的繁殖，有益菌得以繁殖扩大，减少土传病害的发生，并增加了土壤肥力。
　 　蚯蚓粪有机肥能适用于各种农作物，既可作基肥，也可以作追肥。也可用于高级花卉营养土、草坪裁培、还可作为无土栽培的基质，无臭无味，干净卫生，不会发 生烧根、烧苗现象。远高于禾本科秸秆，而接近或超过豆科秸杆，大量改善水质的微生物菌群，是各种动物的良好饲料，因此有农民用于养鱼和养虾。
。