青贮的过程主要是多种微生物发酵的过程，主要是乳酸菌发酵产生乳酸，降低青贮料的pH值，乳酸本身既是营养物质，又有抑制饲料中其他微生物（如腐败微生物）生长的作用，使饲料能够长期保存下来。因为乳酸菌是厌氧菌，所以青贮操作必须严格压实，尽量排净空气，这样利于乳酸菌发酵。如果青贮没有压实或青贮料青贮料中乳酸菌不足，产酸不够，就容易引起发霉。 丁酸菌是一类严格的厌氧性梭状芽孢杆菌，在无氧条件下进行丁酸发酵，它们分解单糖、双糖、乳酸、淀粉、果胶、和纤维素等，产生丁酸、二氧化碳和氢气使饲料发臭，降低青贮料的品质。丁酸发酵的程度是鉴定青贮饲料好坏的重要指标，丁酸含量越多，青贮料的品质越坏，丁酸菌还能利用各种有机氮化物，从而破坏青贮料中的蛋白质，使营养损失。但丁酸菌不耐酸，因此有大量乳酸菌作用时，可以有效抑制其作用，保证青贮品质。

探索建立有效的秸秆田间处理、收集、储存及运输系统模式。加快建立以市场需求为引导，企业为龙头，专业合作经济组织为骨干，农户参与，政府推动，市场化运作，多种模式互为补充的秸秆收集储运管理体系。