在腐植酸肥料中有很容易就能与钙离子产生反应的一些功能团，在通过作物根部正常代谢使得土壤得以团粒。提高了泥土的透气性，土壤的空间密度也变大了，这样更利于作物的生长。

  腐植酸的另外一个作用就是能够将土壤中的金属离子固定住，避免它们影响作物的生长，也能够提高泥土的稳定性能。

  腐植酸能抑制土壤固定的磷吸附效果，因此，它可以增加土壤中磷的活动范围。使得磷的使用率提高了很多，也可以解放一些被固定住的磷的，增加土壤中磷的含量，提高肥效。

  腐植酸有机肥料对于提高钾肥的利用率以及提高钾肥肥效也是有着非常显著的作用，这些都要归功于腐植酸强大的离子交换和吸附的作用。

  它还可以改善作物的光合作用为作物提供超强的光合作用，能够使作物果实提前着色成熟。还可以根据不同的地理位置，改善作物的生长环境，提高作物生长能力。