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明确的“组团”存在是这种结构的典型特征。分子型结构可以理解成为由功能相近的建筑组成相对独立明确的组团,通过一定的交通方式和校园中心发生联系,形成主从明确、结构统一的整体。由干这种结构类似于化学中的分子结构,所以有些专著将它称为“分子型”结构。在大学中,各个不同的学院或者较大的系,往往具有 自身独立的结构并和校园中』自联系相对较弱,同时由于网络技术的成熟,避免了大量的人流交通,这些学院可以相对独立地布置在校园中。因此,分子型空间结构由于结构明确,功能符合大学校园的要求,受到很多设计师的关注。  英国的肯特大学（University of  Kent）校园是传统校园中典型的分子型布局。波特曼事物所（John Portman and Associates）,设计的印度商学院在宽裕的基地上（250公顷）设计了由四个独立的学生宿舍组团围合中央教学区而形成的大学园区,体现了一种独特的宗教图式意味,不过总让人感觉有流于形式和构图之弊。天津大学建筑设计院设计的燕山大学西校园文化规划中标方案中,六个组团围绕中央绿化景观公 园布置,通过步行学生街有机的联系起来,各个学院各 自独立而又有机地结合为一个整体。
    分子型空间结构可以归结出以下几种主要特征： 
1.校园结构条理清晰不同类型和功能的建筑组团形成了分主从、有层次的校园结构,产生 了校级公共空间—学科组团级公共空间—系级公共空间这一完整的教学建筑体系,各级别的服务关系非常明确。  
2.结合地形 良好,易形成园林化的教学空间环境分子型结构摆脱几何关系控制下、的任硬和呆板,在平面布局上提供了很大的灵活性,能够顺应基地的地形和地势,灵活地表达设计内容。在基地的容积率较低的情况下,可以形成类似于公 园的布局效果—一个个“景点”掩映在绿树丛中,形成一座可以服务于城市,供市民休闲并提高自身素质的文化的园林。  
3.建筑设计兼顾共性和个性分子型结构是建立在规划结构层面上的一种统一,建筑组团和单体设计则相对具有很大的独立性,有比较充裕的设计表达空间,可以更好地表达建筑个性特征,产生明确的识别性。  
4.一种可持续发展的规划观念的体现各个教学单元可以根据需 要合理增减,而不会对校园整体功能和空间构图产生不利的影响 而且,各个教学组团可以分期建设,分批投入使用,整个校 园始终相对完整,这也是针对大学建设周期长而提出的一种积极的解决思路。  
5.一定程度上有利于“开放性”的实现考虑到我国内向型的民族传统居住习惯和维护校园治安等因素,我国大学校园只能保持适度的“开放”。分子型布局 利于实现一种“大开放,小封闭”的格局。一方面取消围墙限制,学校的公用建筑如图书馆、体育馆、试验楼,在保证正常使用前提下服务于社会,可避免城市重复建设 另一方面,各个教学单元组团内部实行科学严格的管理,相对封闭起来,保证校园治安和正常的教学活动不受干扰,这时每个组团又形成了单独的封闭的小校园。