水果、肉类、谷物和乳制品的加工，以及棉花基本染色、造纸、木材加工等工业排出的污水是农业污水的第三个来源。在发达国家农产品加工污水量相当大，如美国食品工业每年排放污水约25亿吨，在各类污水中居第五位。

       农业污水中的氮、磷等营养元素进入河流、湖泊、内海等水域，可引起富营养化；农业污水中的农药、病原体和其他有毒物质能污染饮用水源，危害人体健康；农业污水还可造成大范围的土壤污染，破坏自然生态系统，使生态系统内的物种失去平衡。

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