嘧霉胺具有保护和治疗作用，是防治灰霉病、的一种高效、低毒杀菌剂，具有内吸传导和熏蒸作用，施药后可迅速传到植物体内各部位，有效抑制病原菌侵染酶的产生，从而阻止病菌侵染，彻底杀死病菌。与其他杀菌剂无交互抗性，而且在低温下使用，仍有非常好的保护和治疗效果。用于防治黄瓜、番茄、葡萄、草莓、豌豆、韭菜、等作物灰霉病、以及果树黑星病、斑点落叶病等。

防治番茄等灰霉病，在发病前或初期，每亩用40%嘧霉胺25-95g，兑水800-1200倍，亩用水量30-75kg,植株大，高药量高水量;植株小，低药量低水量，每隔7-10天用一次，共用2-3次。一个生长季节防治需用药4次以上，应与其他杀菌剂轮换使用，避免产生抗性。露地菜用药应选早晚风小、低温进行。

防治葡萄灰霉病，喷40%悬浮剂或可湿性粉剂1 000-1500倍液，当布生长季节需施药4次以上时，应与其他杀菌剂交种使用，避免产生耐药性。

嘧霉胺也可用于苹果、梨、草莓、韭菜、豆类等作物 。