包埋 （1）先将熔化的石蜡倾入包埋生产模型中，再用加热的弯曲钝头镊子轻轻夹取已经过浸蜡的社团块，使社团块的面或被特别指定处的社团面向下埋入熔蜡中；应将社团块平正地置放于包埋生产模型底面的中央处；包埋于同一蜡块内的多块细小社团应彼此靠近并位于同一最简单的面上；腔壁、皮肤和黏膜社团必须垂直包埋（立埋）。 （2）将与社团块相关的病理号小条置入包埋生产模型内熔蜡的一侧。 （3）待包埋生产模型内的熔蜡表面凝固后，即将生产模型移入冷水中加速凝固。
（4）从包埋生产模型中掏出凝固的包埋蜡块（简称蜡快），用刀片去除社团块周围的过多石蜡（社团块周围保留1~2mm石蜡为宜）。将包埋蜡块修整成为规则的正方形或长方形。 （5）将病理号小条安稳地烙贴在蜡块一侧（编号应清晰可见）。 （6）把修整好的蜡块烙贴在撑持器上，以备切片。 （7）使用包埋机的要领按有关厂商的说明书操作。
注意事项 ①社团块固定、脱水、透明和浸蜡的质量直接影响切片制备。切片过程中碰到的困难首先应注意从切片前的上述各环节中寻找原因。 ②切片机的质量是制备优质切片的重要前提。要使用质量好的切片机，规范地切片，精心维护切片机。 ③经由内窥镜、穿刺等获取的细小社团，应间断性连续切片多面（一般至少制备6张蜡片，须要时制备更多张）。需作特殊染色、免疫组化染色等的病例，可预制蜡片备用。 ④切片人员应细心操作，防范被切片刀具割伤。
透明：因脱水剂不能与包埋介质相溶，因而包埋前应用能与包埋介质相溶的化学试剂将组织中的脱水剂置换出来，该过程即为透明。在这个过程中，组织快中的乙醇被媒介溶剂（即透明剂，如二甲苯）取代，因其折光率接近组织蛋白的折光率，光线可以透过，使组织块呈现不同程度的透明状。
二甲苯为无色透明液体，透明能力强，但易使组织块收缩、变硬变脆，因此组织块在二甲苯中时间不宜过长，以达到组织透明为度（组织块呈现棕黄色或暗黄色透明状即可）。另外，苯、甲苯与二甲苯性质相似，也可作透明剂使用。二者对组织块收缩较少，不易使组织硬化变脆，但透明速度慢，需要60min左右。氯仿的透明能力不如二甲苯，且挥发快，容易吸收水分，多用于大组织块（厚1cm）的透明，透明时间为12-24h。
