养殖场产生的粪污排放造成地表水、地下水、土壤和环境空气的严重污染， 直接影响了人们的身体健康，而未经处理的粪污中含有大量污染物质， 若此种有机废水直接排入或随雨水冲刷进入江河湖库，大量消耗水体中的溶解氧，使水体变黑发臭，造成水体污染。粪污水中含有大量的n、p 等营养物是造成水体富营养化的重要原因之一， 排入鱼塘及河流使对有机物污染敏感的水生生物逐渐死亡， 严重者导致鱼塘及河流丧失使用功能。养殖污水长时间渗入地下， 使地下水中的硝态氮或亚硝态氮浓度增高， 地下水溶解氧含量减少， 有毒成分增多， 导致水质恶化，严重危及周边生活用水的水质。高浓度污水还可导致土壤孔隙堵塞， 造成土壤透气、透水性下降及板结、盐化， 严重降低土壤质量， 甚至伤害农作物， 造成农作物生长受阻或死亡。
猪场废水是比较难处理的有机废水，因为其排量大、温度低、废水中固液混杂，有机物含量高，氮、磷含量丰富且不易去除，单纯使用物理、化学或生物学方法都很难达到排放要求。厌氧法bod(生化需氧量)负荷大，好氧法bod负荷小，在污水厌氧处理过程中，处理后水体仍具有一定的臭味，各项指标并不一定能达到国家排放的标准。养殖污水处理设备一般来说需要采取多种处理方法相结合的工艺，常采用进一步的好氧处理(氧化塘等)来作为厌氧处理的二级净化，这也是目前处理高浓度有机物污水的一种好方法，也是许多规模猪场采用的废水处理方法。经过处理后的污水基本都能达到国家排放标准，但最后一般设置排入鱼塘，一方面通过养殖一体化污水处理设备鱼塘起到更进一步氧化塘的作用，同时藻类复氧提高溶解氧含量，同时促进浮游植物、浮游动物和鱼的生长，形成氮、磷——藻类——鱼生物链，减少氮磷的环境污染。
