硅藻沉积并经亿万年的矿化后形成硅藻矿物，其主要成分为蛋白石，质地轻柔、多孔。硅藻是真核藻类的一个主要类群，硅藻的一个主要特点是硅藻细胞外覆硅质（主要是二氧化硅）的细胞壁。硅质细胞壁纹理和形态各异，但多呈对称排列。这种排列方式可作为分类命名的依据。但是这种对称并不是完全的对称，因为硅藻细胞壁的一侧比另一侧略大一点，这样才能嵌合在一起。