使用通风柜的目的是排出实验中产生的有害气体，保护实验人员的健康。通风柜要有高度的安全性和优越的操作性，这就要求实验人员能够正确使用通风柜。
3.1 通风柜内仪器设备的使用应将仪器和设备尽可能远地放在通风柜内的后部位置，至少应该放在通风柜内离前观察窗20cm左右的距离，以便保证安全和实现最理想的操作。应防止通风柜内的仪器或材料阻挡通风柜后面的气体导流板的排气口。当在通风柜内使用大的仪器时，应将仪器放在台架上，以便空气从它下面流过。当存在易燃液体或气体时，不要放置电气设备或其它发热源在通风柜内，或者让它们靠近热源。这样可以避免低燃点的液体被引燃。
3.2 通风柜使用前的准备实验人员在操作前应仔细阅读实验指导书，熟悉操作程序以及操作细节，避免在实验操作时出现重大错误或事故。实验人员必须熟悉仪器性能及其正确操作方法，准备好实验用的仪器设备和消耗材料。在实验的开始前及终止后，必须以清洁剂(如70%的酒精水溶液)清洗双手。在实验开始前，实验人员必须穿上清洁的实验服，若留有长发须将长发束好，在操作中任何时刻都应装束整齐，必要时穿隔离衣，戴手套、工作帽和鞋套。检查通风系统和面风速是否正常。
3.3 特殊通风柜的使用放射品开瓶、稀释、分装时，工作人员要穿隔离衣，戴口罩、帽子、胶皮手套、防护眼镜等，并应在铅砖、铅玻璃防护屏后进行。应在通风柜内开瓶，开瓶前应按说明书核对放射物的标签，然后将放射源置于通风柜内。开瓶勿用力过猛，以防打碎玻璃容器，造成污染。稀释与分装放射物前应仔细核对说明书的项目；稀释口服液可用蒸馏水，静脉注射剂可用无菌生理盐水；分装放射品时应在铺有吸水纸的搪瓷盘内进行，不要直接在工作台上操作。
3.4 使用通风柜时的注意事项当使用通风柜时，实验人员面部必须在通风柜进风调节板平面的外面，离通风柜的正面至少15cm，并注意空气流动的变化如果有易爆或溅出的物质，实验人员务必戴防护眼镜，并且戴完全保护面部的口罩。在操作过程中不准吸烟、吃东西或使用化妆品(如口红等)。仪器、的使用和操作应准确无误，如准确地从瓶子中取出化学和倾倒易挥发的化学，不要撒落到地上或通风柜内，以提高环境的安全并减少损失。
3.5 对意外事故的处理发生意外事故(如放射品的撒、漏等)应及时封闭被污染的现场和迅速切断污染的来源，防止事故的扩大。对受污染人员应及时采取必要的措施，若污染严重应上报有关部门和领导；若放射品源丢失或被盗，应立即追查去向并向主管部门报告
3.6 “三废”的处理
3.6.1 固体废物的处理主要采用放置法。被有害物污染的固体物质或放射性废物应存放在指定地点，并采用适当的物加以防护。待其自然蜕变后，再当作非放射性废物处理即可
3.6.2 液体废物的处理应根据有害物质的容许浓度、化学性质、危害强度、废液的容积以及下水道的排水设备等情况进行不同的处理。一般采用稀释法达到容许排放标准再排放对放射性物质应采用放置法，半衰期短的也可稀释后排放；一般无害废水可直接排入下水道；不能直接排入下水道的放射性废液可采用衰变池贮存10个半衰期后排入下水道。
3.6.3 气体废物的处理易产生有害气体的物在开瓶、分装时应在通风柜内通风条件下操作。通风柜排气口应高出周围50m内的屋顶3～4m，以使有害气体排入高空。通风柜排气口的过滤装置应视使用情况定期更换。
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