超纯水主要应用在食品及制药行业。随着环境污染的加剧和人们对健康要求的不断提高，食品、饮料行业用水的水质要求也随之提高，高纯水在食品饮料行业得到越来越广泛的应用，如饮用纯净水、饮料、酒类等生产用水、饮料的无菌灌装、原材料的运输与清洗、工作场所和设备的高压清洗等。

在人们的生活中起着至关重要的作用，用水水质的好坏直接影响着水平，关系到人的生命安全。早在1990年我国出版的《中华人民共和国药典》二部便规定了蒸馏水、水和无菌用水等三种水的要求，规定了十一项指标：PH、氯化物、二氧化碳、易氧化物质、不挥发物质、重金属及热源。可见超纯水在行业的重要性。