睡莲是多年生浮叶型水生草本植物，根状茎肥厚，直立或匍匐。叶二型，浮水叶浮生于水面，圆形、椭圆形或卵形，先端钝圆，基部深裂成马蹄形或心脏形，叶缘波状全缘或有齿；沉水叶薄膜质，柔弱。花单生，花有大小与颜色之分，浮水或挺水开花；萼片4 枚，花瓣、雄蕊多。果实为浆果绵质，在水中成熟，不规律开裂；种子坚硬深绿或黑褐色为胶质包裹，有假种皮。品种不同其形态特征不同。

白睡莲（N. lous）：原产埃及尼罗河，花径20~25cm，大花型，挺水开放。花色白，花瓣20~25 枚，长卵形，端部圆钝。萼片绿色，脉纹明显。花梗、叶梗绿色有柔毛。叶径42~40 cm，叶面绿色，叶背微红，叶缘波状有锯齿。雄蕊淡黄色，70~100 个。蓝睡莲(N. caeruloa)：原产北非、埃及、墨西哥。花径15~20 cm，大花型，挺水开放。花瓣16~20枚，花开呈星状。花梗、叶梗淡红棕色。叶径32~30cm，叶面绿色，叶背暗红紫色，有紫色小斑块，叶缘略微波状，叶基深裂。雄蕊80~100 个。

黄睡莲（N. mexicana）：原产北美洲南部墨西哥、美国佛罗里达州。花径10~14 cm，中花型，花开浮水或稍出水面。花色鲜黄，花瓣24~30 枚，卵状椭圆形。幼叶叶面密集紫斑，成叶绿色，叶背密集深紫色斑点，叶缘全缘，叶基浅裂。雄蕊鲜黄色，60~90 个。

红睡莲（N. rubra）：原产印度、孟加拉一带，花径20 cm 左右，大花型，挺水开放。花色桃红，花瓣20~25 枚，长卵形，萼片紫红色，脉纹明显。花梗、叶梗暗紫色。叶径42~40 cm，幼叶叶面紫红，成叶绿色，叶背有柔毛，叶缘波状，有锯齿，叶基深裂。雄蕊黄色，70~100 个，人工授粉可结实。