目前，国内外地下水自动监测系统中的通信方式主要有超短波、短信、PSTN固定电话及GPRS无线数据传输方式。各种通信方式均有其优缺点，本系统采用GPRS通讯方式为主通道、GSM短信通讯为辅助信道的组网方式。
监测站采用自报、自报－确认工作体制采集水位数据。通常监测站的数据采集终端处于微功耗职守状态，GPRS通信终端、水位传感器处于掉电工作状态，每当设定的时间（1小时）到时，监测站的数据采集终端自动进入工作状态，并打开GPRS通信终端、水位传感器的电源，监测站等待水位传感器稳定工作后，采集水位数据并将该数据和时标写入自记内存，如果满足发送数据条件，监测站主动启动GPRS拨号，建立PPP连接，监测站注册，然后发送采集到的水位数据。