过去，我国的基金申请科学研究经费，一直是由有关单位以无偿科研拨款形式支付之；近年随着改革的不断深入发展，这种形式正在发生着改变，在某些经济效益较为明显的科研合同中，已经出现了关于如何偿还科研经费的条文，以社会效益为主的医学科研所需经费，究竟应该采取何种形式为最佳，人们也正在积极研究和探索之中。
    编制研究经费概算时，大底可以从以下几个方面加以考虑：
    （一）仪器设备费
    按照规定科研经费不得用于购置大型精密仪器设备，只能用于该项课题所不可缺少的某些中、小型仪器设备的补充。就是说课题所需之主要设备原已具有，只需添置个别的一两件仪器、便可保证课题的顺利完成，或者是可以明显提高研究工作的质量。不属于此类性质者不得编入研究经费概算。
    （二）试剂材料费
    科研工作往往需要一些特殊的试剂，此类试剂不仅价格昂贵，而且有时奇缺，因此亦需事先落实。实验材料除试剂以外，还有以下三类：①课题所需要的特殊材料，如各种气体、液体、血清、培养基、实验动物等；②低值易耗品，如各种瓶罐、试管、烧瓶、滴管、玻片、棉花、纱布、泡沫塑料、胶管、注射器等；③记录用材料，如各种表格、卡片、描记图纸、微机打印纸以及某些声像记录材料等。上述所有材料和试剂，均应分别注明其用途、名称、规格、数量和金额。
    （三）技术协作费
    基金申请研究课题中的某些个别项目，研究组本身或本单位有时难以完成，需委托其他专业单位予以协助或聘请技术顾问等，此类开支属于技术协作费。
    （四）其他费用支出
    此中包括情报调研、图书资料、人员培训、经验交流、差旅交通、仪器维修、办公用品等所需各项费用。如果在研究过程中还要涉及到其他的人，则经济补贴问题亦需加以考虑，如临时工的工资、集体制医务人员的工资补贴、乡村脱产干部的误工补贴、志愿受试者的营养保健费、以及某些人员的伙食补助费、加班费、劳务费等。这些费用既应合理报酬又应防止滥发。
    以上四类费用分别计算并汇总以后，便形成该项设计中研究经费预算的总金额，同时应注明本单位的开户银行及帐号、请求拨款的日期和货币种类。一些较小的课题因金额不大常一次性拨款；周期较长的大课题，一般皆按年度计算分期拨款，并与研究工作的进度相合拍，有些科研设计书附有一定格式的课题经费预算表，可按其规定要求逐项编制。
    申报科研课题的重要目的之一，往往是想获得有关方面的一些经济资助。如果这种资助是由国家给予的无偿拨款，则应明确以下几点认识。第一，资助毕竟只是一种“资金帮助”性质，而非完全依赖或实报实销，主要力量和设备等尚需自行解决，不宜主次颠倒，否则未尝不可以认为现有研究条件不具备。第二，专款必须专用，下达的经费只能用于与该项课题研究有密切关系的支出，不得滥用或挪作它用。第三，应该精打细算，我国的财力日前尚不充裕，一项课题不可能花钱大多，需要发扬我国科技人员传统的艰苦奋斗的精神，勤俭节约，减少开支。第四，坚持实事求是，以较低的或适当的标准编制经费预算，不打“埋伏”，不带“水分”，不有意加大经费金额；审批部门亦应同样坚持实事求是，并充分理解和相信我国的科技人员，在经费审核方面既应有合理的削减，也需要有主动的补加。如此，才能清除一些不良社会思潮的影响，克服日趋严重的讨价还价现象，树立起一种高尚的良好的科研风气。