个人认为，发表sci论文需要掌握一些基本的工具，我个人用的
photoshop

Adobe Illustrator
这两个主要是处理图片的，PS不说了，Adobe Illustrator主要我用的也比较单纯，图片大小如120X80mm 和像素300dpi，格式如cmyk 等都用此处理的，一般图片在幻灯片中像素太低，反复转换几次容易失真，所以做好开始就用Adobe Illustrator，存为300dpi，tif格式；电泳或western图片扫描最还选300dpi，用ps裁剪好，标注文字后，用Adobe Illustrator保存修改比较方便。

word
英文字体 行距 纠错等等功能

excell
基本绘图。。。

文献王
参考文献，endnote也不错；写外文的文章还是要用软件插入参考文献的，否者实在不便；

总之，我只是一个菜鸟，这些软件只是会一点基本的，图片基本能满足sci论文的需要；还请高手多多指点；

主要是图片的处理和排版很重要，看下了一些硕士生的论文，图片不规范，格式不规范，这些都是很致命的问题，整个中文期刊和英文期刊差别很大，但是图片和数据的规范性还是很有差距的。