棉签可以用来清洁用传统的方法无法到达或清洁的区域、裂缝和缝隙。一旦棉签拾起了残留物，就不能让它再掉出去。棉签采样可能是应用最广泛的清洁确认采样技术。这是在清洁确认评估中最重要的环节。棉签和基片表面的物理特征和物理擦拭移动在物理确认程序中都起到了一定的作用。化学程序包括用蘸湿的棉签从基片表面上获取要分析对象的样本，然后从棉签中提取分析物，最后再把棉签放到恢复溶液中。擦拭移动的步骤必须标准化，这样才能保证在分析研究过程中通过擦拭移动再现、进行恢复确认。这个程序应列入标准的操作程序中

棉签的主要优点是可以用不同材料做成各种形状。因此，它们更合适用来清洁非常微小、非常精确的区域。    棉签的主要应用领域集中在洁净室、集成电路、精密仪器、液晶显示器、微电子、生物医药、汽车、硬盘、光学、食品工业及航天航空领域