操作一个有效的温控箱应当能够快速而安全地将整个系统的温度升高到预定点。

有3种途径可以实现：从动式动力--这项功能使整个系统加热到预定温度而无须担心要补偿较大的冷分流器。将较小的注嘴加热，从而使加热器的寿命更长。从动式动力对每个区域都保持监控，使快速加热区的温度上升速度减慢，直到其他区域的升温速度赶上来为止。这办法能够使一个由不同的热质量体组成的系统儘快升温到预定温度，无须延长较小元件的加热时间。

宽带控制：用一套参数，控制器有足够的灵活性来有效控制不同的质量体（即较大的分流器和较小的注嘴）的温度，无须操作人员另行输入其他参数。操作人员不必根据质量体的情况对某个区域进行较准计量，所以可节省时间，也减少发生错误的机会。

温控箱烘烤--鉴於加热器会吸收湿气，所以在启动时，加热器容易发生短路。湿加热器烘烤可调节电压度和功率，从而儘快将湿气驱散而不会令加热器发生短路。如果加热器是乾燥的，控制器也知道将电源立即接上，使系统儘快启动。不过，如果有湿气，为了能够安全迅速地将湿气烘乾，控制制器会採用降压电源，然后再根据当时的湿度情况，以适当的速率逐渐恢復到原先的功率。

加热器的保护加热器的启动方式有两种：电压式比例及时间式比例。虽然电压式与时间式比例将相同数量的动力传给加热器，但它们传送动力的方法却是不同的，这一差异会影响加热器的使用寿命。时间式比例是以脉衝方式传送动力，每次以100%的动力来震动加热器，使加热器元件内部的温度偏离增大。这样会使加热器元件迅速老化。则电压式比例则是更频繁地使用较小的能量脉衝，让加热器元件较少与极端温度接触，减少热震动和热疲劳，从而延长加热器的使用寿命。