利用微波的热效应和非热效应，进行低温干燥和杀菌处理，微波能量直接辐射到药品中，使药品内部温度升高，产生压力，加速被约束水分子的转移，被处理物品中的水份逐步向外蒸发，此时微波设备中再通以适当的热风，将蒸发出来的水份带走。

　为了保证产品质量，药材干燥设备应严格控制热风温度、湿度和流量。利用微波干燥处理药品不仅大大提高产品质量，并可大大缩短干燥时间和节约大量的能源，经济效益十分明显。与远红外加热相比可节省30%左右。由于微波加热杀菌是使药材本身成为发热体，不需要热传导等过程，微波从四面八方穿透药材内部里外同时使物料在短时间内达到均匀加热杀菌效果，一般仅需3-5分钟。