国—新西兰自由贸易区优惠原产地证明书采用统一规定的格式，证书编号不得重复，证书包括的货物应在一份进口报关单上，并用英文填制证书。
此外，还应注意证书第7栏所列产品项目不得超过20项，证书第10栏中所指HS编码应填写我国现采用的国际协调统一的六位HS编码。
正确标明原产地标准
原产地标准应在证书的第11栏中加以标明。该栏目的填写必须真实准确，否则新西兰海关将对货物是否具备原产地资格产生怀疑，从而引发原产地核查，甚至拒绝给予关税优惠待遇。
出口申报
货物出口时，发货人必须按照《中华人民共和国海关进出口货物报关单填制规范》（海关总署公告2008年第52号）规定填制报关单，并向海关提交原产地证书电子数据或者原产地证书正本的复印件。
符合直运规则

出口享受关税优惠的货物应是在中国与新西兰之间直接运输的货物，即符合直运规则。根据《协定》规定，下列情况应视为直接运输：
货物运输未经中国和新西兰之外的第三国或地区境内；
货物运输途中经过中国和新西兰之外的一个或多个国家或地区境内，不论是否在这些国家或地区转换运输工具或临时储存不超过六个月，只要货物在其境内未进入其贸易或消费领域，并且除装卸、重新包装或使货物保
持良好状态所需的其他处理外，货物在其境内未经任何处理。为符合上述规定，应向新西兰海关提交非缔约方海关文件或任何其他文件加以证明。

不能享受关税优惠待遇的情况
原产地证书未正确填写或签章；
货物的原产地不符合中国—新西兰自由贸易区原产地规则的规定；
原产地证书中的信息与所提交的证明文件不相符；
所列货品名称、数量及重量、包装唛头及号码、包装件数及种类与进口货物不相符。
在拒绝给予优惠关税待遇时，进口方海关应向进出口商书面说明该决定的理由。
2008年4月7日，新西兰完成它经贸历史上的第四个“中国第一”：
1. 第一个与中国展开FTA谈判的发达国家；
2. 第一个完成中国入世双边谈判的国家；
3. 第一个承认中国完全市场经济地位的国家；
4. 第一个与中国完成自由贸易区（FTA）谈判的发达国家