医药工业废水主要包括四种：合成药物生产废水，抗菌素生产发酵废水，中成药生产废水和各种制剂生产过程的洗涤水和冲洗废水。制药废水品种多，生产规模差别大，单位产品排放污水量大，废水组分复杂，污染物浓度高，含有大量有毒有害物质，属于难治理之列。
    1、均和模块
    由于一般用户来水水量、水质不稳定，为保证后续处理单元水量稳定，设立均和模块起到均匀水质、调节水量的作用。在该设备的均和模块处理过程中，废水经格栅去除大部分的大颗粒固体悬浮物后进入调节池对废水的水质和水量进行调节。 
    2、零速气浮模块
    废水添加絮凝剂后进入零速气浮模块，气浮设备进一步去除油脂、BOD和悬浮物。多元公司采用的浅池零速高速气浮是依据“浅池理论”和“零速理论”设计的，停留时间只有3~5分钟，表面负荷高达8~12m3/m2.h，悬浮物去除率最高可达99.5%，出水悬浮物可低于30mg/L，而且具有多项调节功能，能够随水量水质而变化。
    3、生物处理模块
    废水从气浮设备自流进入生物处理模块，经水解池酸化水解后进入SBR反应池。SBR处理工艺集均化、初沉、生物降解、二沉等功能为一体，处理效果明显优于于传统的活性污泥法。处理系统已设置格栅和调节池，故未设置初沉池。SBR反应器中的底物浓度从进水的最高逐渐降解到出水时的最低，整个过程底物没有被稀释，过程推动力始终比完全混合反应高，因而比完全混合反应法所需的氧化时间和池容积小得多，通常只为1/3。而且由于采用SBR处理装置，反应池、水泵、配管数目少，无需设置二沉池，反应池容积也比传统活性污泥法小，占地面积随之大大的节省了，土地费用和建造费用也可大量削减。曝气系统则采用多元公司研制的推流式液下曝气机，曝气效果、占地、噪声、动力消耗和操作维护等都明显优于其他曝气设备。经SBR池处理后可以直接达标排放。