灵芝最好晾干或低温烘干（温度不超过摄氏55度）收藏，并要通风，防止霉变和虫蛀。新鲜灵芝在短期内使用，可放冰箱内暂存。 灵芝因比较硬，不能直接服食，通常是削成薄片后，煎煮食用。煎煮最好用沙锅，煎煮出来的汁液可倒入玻璃器皿中保存。一天的用量因目的而定，若是保健用，一般为10克，则可食用15～30克。将一天的用量连煎两次，每次煎煮时间为沸腾后文火30分钟，将每次浓缩液混合后分两次空腹饮用。除了直接煎煮外，灵芝还可以配以其它药材和肉类炖汤食用，通常选用苦味较淡的黑芝或血芝，一般用量为10～15克。为了充分利用灵芝的有效成分，在煎煮或炖汤前最好先将灵芝泡软和剪碎
方法保存 
新鲜的灵芝可以直接食用，但保存期很短。灵芝采收后，去掉表面的泥沙及灰尘，自然凉干或烘干，水分控制在13%以下，然后用密封的袋子包装，放在阴凉干燥处保存。市场上散装的灵芝，使用前最好清洗后食用。 置干燥处，防霉，防蛀。二、食用方法 灵芝糖浆(约30％)每日2次，每次20毫升。(或灵芝6～9克，水煎服)。
　　　灵芝6～9克，水煎服。
　　　灵芝6克，甘草4．5克，水煎服。
　　　慢性气管炎灵芝9克，南沙参、北沙参各6克，百合9克，水煎服。
　　  灵芝16克，半夏3克半，苏叶6克，厚朴3克，茯芩9克，水煎冰糖，一日2—3次分服。
　　  灵芝煎浓汤，过滤后，频频滴鼻。
　　　服用时应注意两点： 
　　（1）内服研末或浸酒，每次2～3克。现代多改为片剂，每次3～4粒，每日3次，或用针剂，肌肉注射，每日1～2次。忌超量，因实验表明：大量则发生副作用，能使动物致死。 
　　（2）久服。若治病一般须1个月以上；若预防衰老，则应连服3个月以上，停药3个月，再服的间歇服药法，效果才佳。