犊牛腹泻的发生，与胎儿发育期的条件以及外界环境的影响有关。因地区和季节等的不同，犊牛患腹泻的情况也不一样。归纳起来，主要有以下几方面的原因引起。
1.细菌引起产肠毒素性埃希氏大肠杆菌(ETEC)、弯曲杆菌、沙门氏杆菌、产气荚膜梭状芽孢杆菌等均可引起犊牛腹泻。而ETEC是引起1周龄内的犊牛腹泻的主要细菌，其侵入犊牛体内后释放一种或两种肠毒素而导致犊牛腹泻。产气荚膜梭状菌是犊牛患肠毒血症的病原菌。
2.病毒引起轮状病毒、冠状病毒、星形病毒、盏形病毒、微病毒等都可引起犊牛腹泻，而轮状病毒和冠状病毒起着重要的病原学作用。
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