3500测序仪
北京拓普塞斯生物技术有限公司成立于 2008 年,是湖北三七七生物技术有限公司的全资子公司,我司自成立至今始终致力于各种类型的生物学仪器的销售、维修维护等服务。如测序仪、合成仪、扩增仪、蛋白纯化仪、自动工作站和气相色谱质谱联用仪等,公司尤其在 ABI 各种型号的基因分析仪方面有丰富的维修维护经验。
3500测序仪用于分析人类DNA或RNA,以检测有可能导致疾病发生或易感的基因改变。研究人员采用3500测序仪系列产品每天可进行高达1,100次测序或1,200份样本的基因分型。该产品采用一种新型的耗材设计,将采用射频识别标签追一踪关键信息的能力、新款光学和热学亚系统、重新设计的数据采集和分析软件集成起来,形成了一套用于高品质数据分析的更具成本效益的方法。
北京拓普赛斯3500测序仪具备经过验证的技术、可靠性和性能,已获得公认,3500测序仪系列基因分析仪是构筑于这一历史沿革上的更为强大的先进基因组技术阵容中的一部分。
北京拓普塞斯生物专注测序仪销售与维修服务,主营产品型号:有373测序仪、377测序仪、310测序仪、3700测序仪和3100测序仪型等dna测序仪。欢迎您致电联系我们获取更多优惠~~~
测序仪指标
北京拓普塞斯生物技术有限公司成立于 2008 年,是湖北三七七生物技术有限公司的全资子公司,我司自成立至今始终致力于各种类型的生物学仪器的销售、维修维护等服务。如测序仪、合成仪、扩增仪、蛋白纯化仪、自动工作站和气相色谱质谱联用仪等,公司尤其在 ABI 各种型号的基因分析仪方面有丰富的维修维护经验。
1高数据通量:每次仪器运行单端读取至少可生成300G碱基数据,双端读取至少可生成600G碱基数据;在快速运行模式下27h内产生120G数据2 实验时间:单端读取4天,双端读取8天(根据测序长度略有变化); 快速模式27h3运行成本:从样品制备到数据读取,每测量100万个碱基对所需成本不高于0.05美元4数据读长:单端读取序列,读长大于100个碱基;5双端读取序列:高通量模式读长2x100个碱基;快速模式读长2x150个碱基6样品用量:DNA样本需要0.1-1微克gDNA或cDNA7读取精度:原始数据准确性≥98.5%,3倍覆盖拼接序列准确性≥99.99%8可准确读取≥10个的连续单个重复碱基(如AAAAAAAAAA),准确性≥98.5%9不同样品并行性:每次仪器运行可平行分析8个非混合的独立样品10 可开展ChiP-seq、小RNA发现的定量、未知物种测序、转录组研究、甲一基化研究试剂盒,宏基因组研究、重测序、目标区域重测序。
北京拓普塞斯生物专注测序仪销售与维修服务,主营产品型号:有373测序仪、377测序仪、310测序仪、3700测序仪和3100测序仪型等dna测序仪。欢迎您致电联系我们获取更多优惠~~~
二代测序仪的操作流程
北京拓普塞斯生物技术有限公司成立于 2008 年,是湖北三七七生物技术有限公司的全资子公司,我司自成立至今始终致力于各种类型的生物学仪器的销售、维修维护等服务。如测序仪、合成仪、扩增仪、蛋白纯化仪、自动工作站和气相色谱质谱联用仪等,公司尤其在 ABI 各种型号的基因分析仪方面有丰富的维修维护经验。
1)测序文库的构建(Library Construction)
首先准备基因组DNA(虽然测序公司要求样品量要达到200ng,但是Gnome Analyzer系统所需的样品量可低至100ng,能应用在很多样品有限的实验中),然后将DNA随机片段化成几百碱基或更短的小片段,并在两头加上特定的接头(Adaptor)。如果是转录组测序,则文库的构建要相对麻烦些,RNA片段化之后需反转成cDNA,然后加上接头,或者先将RNA反转成cDNA,然后再片段化并加上接头。片段的大小(Insert size)对于后面的数据分析有影响,可根据需要来选择。对于基因组测序来说,通常会选择几种不同的insert size,以便在组装(Assembly)的时候获得更多的信息。
2)锚定桥接(Surface Attachment and Bridge Amplification)
Solexa测序的反应在叫做flow cell的玻璃管中进行,flow cell又被细分成8个Lane,每个Lane的内表面有无数的被固定的单链接头。上述步骤得到的带接头的DNA 片段变性成单链后与测序通道上的接头引物结合形成桥状结构,以供后续的预扩增使用。
3)预扩增(Denaturation and Complete Amplification)
添加未标记的dNTP 和普通Taq 酶进行固相桥式PCR 扩增,单链桥型待测片段被扩增成为双链桥型片段。通过变性,释放出互补的单链,锚定到附近的固相表面。通过不断循环,将会在Flow cell 的固相表面上获得上百万条成簇分布的双链待测片段。
4)单碱基延伸测序(Single Base Extension and Sequencing)
在测序的flow cell中加入四种荧光标记的dNTP 、DNA 聚合酶以及接头引物进行扩增,在每一个测序簇延伸互补链时,每加入一个被荧光标记的dNTP就能释放出相对应的荧光,测序仪通过捕获荧光信号,并通过计算机软件将光信号转化为测序峰,从而获得待测片段的序列信息。从荧光信号获取待测片段的序列信息的过程叫做Base Calling,Illumina公司Base Calling所用的软件是Illumina’s Genome Analyzer Sequencing Control Software and Pipeline Analysis Software。读长会受到多个引起信号衰减的因素所影响,如荧光标记的不完全切割。随着读长的增加,错误率也会随之上升。
5)数据分析(Data Analyzing)
这一步严格来讲不能算作测序操作流程的一部分,但是只有通过这一步前面的工作才显得有意义。测序得到的原始数据是长度只有几十个碱基的序列,要通过生物信息学工具将这些短的序列组装成长的Contigs甚至是整个基因组的框架,或者把这些序列比对到已有的基因组或者相近物种基因组序列上,并进一步分析得到有生物学意义的结果。
北京拓普塞斯生物专注测序仪销售与维修服务,主营产品型号:有373测序仪、377测序仪、310测序仪、3700测序仪和3100测序仪型等dna测序仪。