辅助加热系统采用电加热（也可用其他辅助热源），当阴雨天无阳光时可启动辅助电加热系统。电加热是由太阳控制系统自动控制启动，功率为XKW，当主水箱水温低于水箱控制仪下限设定时1WDJ1断开。LWDJ2闭合，ICX通电辅助电加热器加热，当水温高于水箱温控仪上限设定，1WDJ1闭合，中间断电器IZJ断电，ICX释放，电加热停止加热。还可以采用燃气设备加热，卓益节能燃气热水机采用全自动智能恒温控制模式，达到预定温度后，水自动保温，当水温低于预设温度时，系统会自动启动循环加热程序给浴水补偿加温，再次达到预设温度后自动停止，让使用水始终保持同一温度。全自动化方便快捷，操作简便。

太阳能热水工程绝大部分都安装在露天风吹日晒，冷热温差大，为保证系统的正常使用，及一定使用寿命，必须对支架、管道等裸露部分进行防腐保温。一般情况下，太阳能热水工程系统就是以上几个重要组成部分，各个不同的公司所设计的热水工程系统会有所不同，但这几个主要部分都是必不可少的。

为了得到温度符合用户要求的热水，通常采用定温放水型直流式太阳能热水系统。该系统在集热器出口处安装测温元件，通过温度控制柜控制安装在集热器入口管道上的温度。根据温度调节水流量，使出口水温始终保持恒定。这种系统不用补给水箱，补给水管直接与自来水管连接。系统的可靠性同样决定于电动阀和控制器的工作质量。