粪尿分集式厕所的特点是粪尿分集式便器有两个排出口，一个出口用来排尿，收集的尿液通过特殊的地表渗透设计可直接稀释做农作物肥料；另一个出口用于排便，收集后的粪便通过另加物料，使之脱水干燥，杀灭病菌和虫卵，在储粪池达到无害化。
农村的根本特点是大部分人家没有下水道，或有下水而没有污水处理系统。农村厕所卫生改造粪尿分集式便器，厕所不用水冲，不污染村庄周边池塘、坑渠、沟壑等。
在农改厕工程建造中，不宜推行水冲式马桶。因为农村不比城市居住集中，不可能建立起有效的化粪设施及相关的污水处理系统。粪便在卫生间冲走以后，直接流入村边的沟、渠、堰、河，含有大量细菌及有害物质的粪便无疑会给下游造成污染。全球每年用水冲厕所浪费掉的自来水合起来就是一个长江，可想而知，用一个长江冲洗掉的厕所废水造成的二次地表径流污染又何止一两个长江呢？粪尿中富含氮磷钾等成分是绿色庄稼的有机肥料，应该很好地施用到农田。粪便无害化处理并加以合理利用，既减少旱厕污水横流蚊蝇滋生，也降低了农药、化肥等化工产品的滥用。
粪尿分集式生态卫生厕所在改善农民卫生生活，还广大农村一个碧水蓝天、鸟语花香的田园风光居住环境，正起着越来越重要的作用。
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