磁控管是电子真空管，微波加热则属于内部加热方式，电磁能直接作用于介质分子转换成热，且透射性能使物料内外介质同时受热，不需要热传导，而内部缺乏散热条件，造成内部温度高于外部的温度梯度分布，形成驱动内部水分向表面渗透的蒸汽压差，加速了水份的迁移蒸发速度。特别是对含水量在30%以下的食品，速度可数百倍的缩短，在短时间内达到均匀干燥。
微波的特点：选择性吸收，不同性质的物料对微波的吸收损耗不同，这对干燥过程有利，因为水分子对微波的吸收损耗最大，所以含水量高的部位，吸收微博功率多于含水量较低的部位，从而干燥速率趋一致。
工作过程中对磁控管的冷却是保证磁控管正常管工作的条件之一，大功率磁控管的阳极常用水冷，阴极灯丝引出部分及输出陶瓷窗同时进行强迫风冷。
不良使用将使磁控管过热而不能正常工作，严重时将烧毁管子，并且会影响其他辅助配件，造成设备停止运行。所以应严禁在冷却不足的不良条件下工作。
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