基因测序通量大，一次反应即可获得大量的测序数据，适用于功能基因组研究的各个领域，包括新物种的测序、已知物种的重测序、SNP位点的验证及发现、构建高密度单倍型图谱、全基因组表达谱研究、RNA水平的可变编辑、小RNA的研究、甲基化研究和蛋白与基因的相互作用等。

测序通量:仪器能平均每天产生大于550亿碱基数据；2、运行成本：从样本制备到数据读取，每测量100万个碱基对所需成本不高于1美元；3、读取精度：原始数据准确性≥98.5％，3倍覆盖拼接序列准确性≥99.99%。可精确读取≥10个的连续单个重复碱基（如AAAAAAAAAA），准确性≥98.5%；4、样品制备过程比较简单，所需样品用量比较少（<10微克gDNA或cDNA/样品）；5、具有多样品并行处理能力；6、能进行双末端序列读取7、序列读取长度达到100个碱基