工厂化循环水养殖主要区别于粗放型或大棚养殖的特点在于“可控”二字。在工厂化循环水养殖一般来说，单个养殖池较土塘要小、水体体积较小，养殖水体的各项指标各以通过种种设备进行调控、改善，保证养殖生物在最适合的水体中进行生长。通过有限的养殖水体，以提高养殖密度、增加养殖批次等方式来提高产量，提高效益。
1、控制水温
一些有条件的工厂化循环水养殖，实现了养殖环境全封闭化，可以通过冷热交换机，控制养殖场所的环境温度、水体温度，保证养殖生物生长在最合适的水体中。
2、控制水源
通过建立源水沉淀池、暴气池、沙滤池等，保证养殖用水的安全，减少有害藻、有害菌的数量。
3、控制溶氧
在较小的养殖水体中，进行高密度的充氧，保证养殖水体中的溶氧能够满足当下养殖密度下的生物需求，以及水体中微生物分解有机物的耗氧需求。
4、控制氨氮
通过添加生物过滤系统，对水体中的氨氮进行分解转化，降低水体氨氮浓度。防止藻类爆发，保持优良的藻相。保证对虾良好的生长环境。
5、控制水体悬浮物
在养殖水的循环系统中，以沙滤或微滤技术，去除水体中的颗粒悬浮物，保证水体透明度，保证水体中藻类光合作用产氧，保证水体溶氧。
6、控制水体有机杂质
以蛋白分离器，通过表面张力，以微气泡去除水体中过多的有机物，保证水体清爽，保证对虾的健康生长。
7、控制水体细菌病毒量
对于有些高端养殖系统，可给养殖水体添加臭氧或紫外线杀菌系统，以杀灭水体中的细菌或病毒，保持养殖水体中病菌数量平稳。
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