分布式电磁阻垢设备输出模块组产生的变化磁场作用于管道和水，激励循环水中带电离子，大幅增加碰撞几率，使碳酸钙晶体在水中形成不稳定小微晶体，同时激励水分子，降低水分子张力，提高溶解度，从而达到阻垢除垢的目的。
再者，频率和强度不断变化的磁场环境可以影响微生物的生存，抑制循环水系统菌藻等微生物的繁衍。