水通过电渗析器中离子交换膜，在直流电场的作用下，对水溶液中电解质电解出的阴阳离子具有选择性透过，即阳离子只能透过阳摸，阴离子只能透过阴膜。由膜和隔板组成的隔室，其淡水室中阴离子向阳极方向迁移，通过阴膜而被浓水室中的阳膜阴留在浓水室中；阳离子则向阴极方向迁移，通过阳膜而被浓水室中的阴膜留在浓水室中，由此淡水室中的水可以淡化，浓水室中的溶液浓度增加，从而达到淡化，提纯的目的。