菌种鉴定菌株鉴定
通过DNA测序对微生物进行物种鉴定(菌种鉴定)是比传统生化鉴定更先进的鉴定方法。DNA测序不依赖菌种本身特点,对所有菌种均可使用。比传统生化鉴定更加快速,准确。科佰生物提供的微生物物种鉴定服务包括细菌16srDNA鉴定和真菌26srDNA鉴定、真菌ITS鉴定,通过PCR扩增16SrDNA、26SrDNA或真菌ITS片段,测序后在GeneBank对比即可。
细菌16S rDNA部分序列解析:扩增细菌16S rRNA的全长序列,只使用Seqforward进行一个测序反应(有效序列500-600bp),即可得到含有部分种属特异性的16S信息,是一种较为经济便捷的鉴定方法。
细菌16S rDNA全序列解析:扩增细菌16S rRNA的全长序列,约1,500bp左右,需进行三个测序反应,以得到较为全面的种属特异性信息。
真菌26S rDNA D1/D2区序列解析:PCR扩增真菌26S rDNA D1/D2区片段,长度在500-600bp左右,只需进行一个测序反应*,即可得到26S rDNA D1/D2区序列信息。该方法尤为适合对酵母菌进行鉴定。
真菌ITS区(包括ITS1、5.8S rDNA、ITS2)?全序列解析:PCR扩增真菌ITS区片段,长度在300-1,000bp左右,依据PCR扩增片段的长度,进行一个或两个测序反应,即可得到ITS区全序列信息。
森博Symbol检测中心实验室依托丰富的数据库和多年的经验,可进行真菌、细菌及放线菌鉴定;微生物代谢产物的分析检测;申报农业部饲料、生物农药、肥料和生态制剂批准文号中微生物安全性评价的菌种鉴定,包括生产菌种的序列,形态特征,生理生化特性及鉴定依据、属及种的拉丁文学名和中文译名。对产品中的未知菌种进行分离纯化鉴定到种的水平,对于新菌种还提供一系列的新种鉴定服务,包括菌种的DNA-DNA杂交、醌型分析、脂肪酸测定、G+C%含量测定、细胞壁成分分析(糖及氨基酸)等。
检测项目 | 项目内容 |
常见细菌、放线菌鉴定 | 透射电镜、16S rDNA测序、生理生化、BIOLOG等 |
常见酵母菌鉴定 | 透射电镜、扫描电镜、26S rDNA测序、生理生化、BIOLOG等 |
常见霉菌鉴定 | 扫描电镜、18S/26S rDNA测序、形态特征观察、BIOLOG等 |
常见大型真菌鉴定 | ITS测序、形态鉴别 |
新种鉴定 | 分子生物学、DNA-DNA杂交、醌型分析、脂肪酸测定、G+C%含量测定、细胞壁成分分析(糖及氨基酸)等 |
生产菌株遗传稳定性 | 分子测序、ERIC-PCR(BOX-PCR)检测等 |
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