加入乳制品或糕点馅料中的水果必须具有某些特性，如完整性、良好的硬度和稳定性。添加钙盐可以部分改善这些特性，但经果胶甲酯酶处理可以得到更大的改善。在整果或片状水果中加入这种酶可以使内源果胶在原位脱去甲基。在钙盐存在的情况下，脱去甲基的果胶在较低的pH值下凝胶，提高了水果的硬度。

对于水果制品，果酱，沙司，果粒或果片，水果硬化酶能够提高硬度，改善粘度和口感。