食品生产中，要使加工的固态食品物料达到高温需要一定时间的升温过程，导致食品品质损失.而罐头类微波杀菌设备加热的速度是传统加热方式的3~5倍，因此可以在保证杀菌效果的同时有效降低产品的质量损耗.尤其在固体和半固体食品中应用微波杀菌的效果可与高温瞬时杀菌技术相媲美.
而家用级的电器只需要符合3C标准，属于B级绝缘即可。由此可见工业微波设备器件的整体配套比传统电加热器件标准要高很多，整机的配套中微波加热箱体和桥身支架、电源架等都为非标定制、传输系统的输送带也必须为微波专用输送带、在整机配套的机械部分人工制造参与量较多，还需要配套防微波泄漏的抑制器等必须的部分。再加之工业微波设备无法做到量产，所以每台设备的价格都需要以相合适的配套工艺来报价。肯定比传统的电加热设备造价上要高出一倍多。但工业微波的优势就是节能、快速、高效，能代替传统的电加热设备不足之处，增加了产量还减少了能耗，是新一代的电热应用技术。
微波对微生物的影响除热力效应外，还存在非热力效应作用.非热力效应是指在温度没有明显变化的情况下，细胞所发生的生理、生化和功能上的变化，又称生物效应.微波加热过程是交变电磁场对物料中水、蛋白质、核酸等极性分子发生作用，使极性分子产生高速取向运动，相互摩擦，导致内部温度急剧升高，使微生物细胞内的蛋白质、核酸等分子结构改性或失活，对微生物产生破坏作用.在升温的同时，微波会使细胞膜破裂和改变脂质体的渗透性，对微生物细胞赖以与外界交换能量和信息的保持其正常生态活动的离子通道产生影响，使微生物细胞出现调节功能严重障碍，达到灭菌的目的.