其实水体本身所含的微生物有一个本底值，这些微生物是肉眼看不见的，而且90%多的也是无法人为培养的，能培养的好氧菌基本是106-108CFU/L，我们简单的乘以10倍表示水体总菌数，结果是107-109CFU/L。我们人为加入的芽孢杆菌仅为106CFU/L的水平，相对于水体微生物的本底值，其实水体本身好氧菌的耗氧量才是大头。

芽孢杆菌不仅可以直接吸附重金属离子，还可以通过影响土壤理化性质（包括土壤pH、阳离子交换量、有机质含量、氧化还原电位、土壤微生物等）来改变重金属在土壤中不同形态的分布。杨榕等研究发现胶质芽孢杆菌能分泌有机酸，降低植物根际土壤pH，从而提高土壤有效态Cd的含量，进一步证实了土壤有效态Cd与土壤pH呈负相关。胶质芽孢杆菌和巨大芽孢杆菌的解磷、解钾作用能增加土壤中的阳离子交换量，而阳离子交换量越高，说明土壤胶体的负电荷量越高，通过静电吸附的Cd2+就越多。

人们常在池塘养殖鱼类中吃出一股土腥味，这种异味主要是由geosmin 和MIB两种化合物引起。鱼类的土腥味常在夏季蓝藻水华时出现，颤藻、鞘丝藻、微囊藻、鱼腥藻等属种是造成土腥味的常见种类。其中微囊藻还可以产生化合物和蒜味化合物，这些物质都是藻类的次级代谢产物，它们通过鱼鳃和皮肤进入鱼体后大量富集，产生异味，严重影响养殖鱼类的销售。