芽孢杆菌在其代谢过程中，分解糖类物质（包括葡萄糖、蔗糖、淀粉、纤维素等）形成水和二氧化碳，这个过程需要消耗氧气。就不同菌株而言，其耗氧量是存在较大差异的。1×109CFU芽孢杆菌在5天时间内的耗氧量，耗氧高的一株芽孢菌5天时间内仅消耗7mg的氧气。为了提高检测灵敏度，实验中刻意提高了菌的用量。那我们计算下池塘实际用量，含量为100-200亿/g芽孢杆菌正常用量为100-200g/亩?米，可以计算出每L水体菌量为3×106CFU，是实验中用量千分之一，由此可以看出加入池塘芽孢杆菌的耗氧量可以忽略不计。

芽孢杆菌修复重金属Cd污染的作用机制比较复杂，需要进一步研究芽孢杆菌与土壤矿物颗粒、植物分泌物的相互影响，以改善修复效果。巨大芽孢杆菌和胶质芽孢杆菌等能活化土壤重金属Cd，增加Cd在土壤中的转移性，容易引起土壤和水体的二次污染。应深入研究修复剂施用方法，极大地提高芽孢杆菌辅助植物修复土壤Cd污染的效率。

重金属阳离子与分子或带有自由电子的阴离子能够发生络合、螯合作用。芽孢杆菌表面带有大量的阴离子活性基团，如-OH、-COOH能吸附重金属离子形成重金属配合物，降低迁移率。刘红娟等筛选到一株对Cd具有较高抗性和富集能力的蜡状芽孢杆菌，通过红外光谱分析发现，蜡状芽孢杆菌细胞壁上活性基团-OH、-NH-、-COOH、-PO43- 和-M-O（O-M-O）（M 为金属离子）与重金属Cd2+的络合密切相关。孙静等通过考察地衣芽孢杆菌富集镉的特性及机理，发现地衣芽孢杆菌对Cd2+的吸附以表面吸附为主，细胞壁上的羧基、羰基、酰胺基含有大量孤对电子，能成为Cd2+的电子供体，发生络合作用，从而实现对Cd的富集。