蜡状芽孢杆菌对Cd、Pb、Cr等重金属具有较强的抗性，可通过静电吸附、离子交换作用、表面络合作用吸附水相中重金属。但蜡状芽孢杆菌用于土壤重金属修复的实例相关报道还不多见。胡永娟利用蜡状芽孢杆菌修复麦田Cr，结果表明小麦幼苗叶和根系Cr含量分别下降8.87%～24.67% ；当蜡状芽孢杆菌与米根霉联用时，可使小麦地上部和地下部Cr含量分别降低42.15%～46.91% 和26.11%～48.24%，土壤有效态Cr含量下降2.1%～9.0%，说明蜡状芽孢杆菌在修复土壤重金属污染方面的应用是具备一定潜力的。目前有关蜡状芽孢杆菌对土壤Cd的修复的实例还比较少，但由于蜡状芽孢杆菌对Cd具有极强的抗性，且对Cd的吸附效果好，使其在土壤Cd污染修复方面的应用具有较大的研究价值。

其实水体本身所含的微生物有一个本底值，这些微生物是肉眼看不见的，而且90%多的也是无法人为培养的，能培养的好氧菌基本是106-108CFU/L，我们简单的乘以10倍表示水体总菌数，结果是107-109CFU/L。我们人为加入的芽孢杆菌仅为106CFU/L的水平，相对于水体微生物的本底值，其实水体本身好氧菌的耗氧量才是大头。

最常见的是养殖池塘有机物含量过多，健康藻类含量低，不管此时是否使用芽孢杆菌，都容易发生缺氧，此时应该开启增氧机，使用化学增氧类底质改良剂，提高养殖池塘溶氧量，降低缺氧风险。虽然芽孢杆菌是耗氧菌，但芽孢杆菌的耗氧量对于养殖水体的溶氧量来说微乎其微，可以忽略不计。使用芽孢杆菌时我们应该注意的是池塘的环境是否有机负荷过重，是否存在缺氧风险。如存在上述风险，建议多开增氧机或配合投放增氧剂。